Estación Científica Yasuni (PUCE), ubicada dentro del
parque, en la ribera del río Tiputini, se encuentra la Estación
Científica de la Pontificia Universidad Católica, dedicada
exclusivamente a la investigación desde 1993. Con capacidad para
albergar 50 estudiosos, su actividad principal es el conocimiento de la
flora y la fauna del lugar a través de varios estudios y proyectos.
Estación de Biodiversidad Tiputini (USFQ), pertenece a la Universidad
San Francisco de Quito, desde 1994 y está ubicada fuera de los límites
del parque, sobre la rivera norte del río Tiputini. Cuenta con una
infraestructura muy completa que incluye salas de investigación,
laboratorios, herbario, casas para estudiantes y una torre de
observación. Se dedica al estudio y la investigación de temas
específicos que responden a diversos intereses sobre la biodiversidad.
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